电影中再次出现了刑讯逼供，为了让依达交待糯康的所在，高刚和方希武将依达通过直升机吊到半空，让他在空中“荡秋千”。
电影刚开始方新武刑讯逼供，很多人觉得这是不对的，作为警察怎么能这么干。但刚刚经历了郭旭截肢，大家对毒贩痛恨到了极点，看到毒贩被吊到空中“荡秋千”，他们非但没有觉得有问题，反而有一种大仇得报的畅快感。
高刚他们利用从依达口中得到的情报，对糯康的几个据点进行了突袭，但糯康已经带着手下跑了，没有找到人，要想抓到糯康，现在唯一的办法就是抓住拿突。
高刚和方新武驱车来到维安队驻地，发现占蓬和拿突变换装束，从维安队溜了出来，上了一辆汽车。他们当即驾车追了上去，并很快与拿突在公路上交火。
经过一段让观众紧张得喘不过气来追逐后，方新武驾驶车，重重地撞在了拿突的汽车上，将拿突的汽车撞得翻了几圈，方新武的汽车也冲出了公路。
拿突被压在了车下，发出阵阵哀嚎。占蓬想要把拿突救出来，可高刚他们冲了过来，他只能放弃拿突，掉头就跑。方新武将自己的手枪别在腰上，捡起占蓬掉落的手枪追了上去。
占蓬对着方新武不断开枪，很快将枪里的子弹打光。他在奔跑的时候脚下一滑，跌倒在地。他见方新武追过来，拿匕首挟持了路边的母女三人，让方新武放下武器。
方新武恨不得打死占蓬，怎么可能放下手中的枪。
占蓬也废话，拿起匕首用力一捅，直接捅死了一个。
银幕前几乎所有观众都被占蓬的凶残吓到了，这家伙简直毫无人性，一言不合就动手杀人，甚至有女记者被这突如其来的血腥场面吓得叫出声来。
方新武恨得咬牙切齿，用枪死死地指着占蓬。
占蓬勒住人质的脖子，作势欲捅，嘴里叫道:“把枪给我！”
方新武没有动，他知道要是放下枪，不但救不了人质还会把自己搭进去。
占蓬怒吼道:“我叫你把枪给我！”
方新武没有别的办法，作为警察他不能看着占蓬杀死老百姓，只能把枪扔掉，然后慢慢后退，准备利用趁占蓬捡枪的瞬间，拔出后腰的手枪将他打倒。
占蓬捡起手枪，正准备对着方新武开枪，结果手一抖，枪掉到地上。
高刚正好赶到，用橡胶子弹打伤了占蓬的手。
银幕前所有心脏悬到了嗓子的观众都微微松了一口气，还好高刚及时赶到，不然方新武可能就要交待在这里了。不过危机还没有彻底解除，他们悬着的心没有完全落地。
方新武将别在后腰，装有橡胶子弹的手枪取出来，对着占蓬开了两枪，让占蓬失去了反抗能力，然后捡起地上装有实弹的手枪，死死地对着占蓬。
他跟占蓬本来就有血海深仇，而刚才占蓬就在她眼前杀死了一名无辜的路人，就连他自己都差点死在占蓬的手中，他真的恨透了占蓬，恨不得一枪打死他。可作为警察，他知道开枪打死已经失去反抗能力的罪犯是在犯罪，他内心处在剧烈的挣扎中。
在他的心里有两个声音，一个声音高呼，打死占蓬！打死占蓬不但能为你女朋友魏蔓报仇，而且是在为民除害！占蓬害死了多少人啊？打死他是为民除害！另外一个声音在不住劝解，方新武你是警察，你不能这么做，要是打死了占蓬，那你跟他有什么区别？
剧烈的挣扎让方新武双眼泛红，双手微微颤抖着。
在很多警匪片中都有类似情节，警察抓到了作恶的仇人，而这个时候他们会陷入纠结状态，到底是坚持原则放过罪犯，还是给他来一枪，以解心头之恨，绝大多数电影主角会坚持原则，放弃报仇，让法律来惩罚罪犯。
现场观众觉得方新武肯定会作出同样的选择，不会打死占蓬，会让法律来惩罚他，像占蓬这样的毒贩肯定会被判死刑，方新武不会动手，也没必要动手。
电影在继续，占蓬被吓坏了，望着杀气腾腾的方希武，哀求道:“方新武，你不可以杀我！就算我死，你女朋友也活不过来！你放过我！”
方新武眼前闪过女朋友举枪自杀的情形，对占蓬的仇恨终于压倒了理智。他冲上前用枪狠狠地顶住占蓬的下巴，带着满腔仇恨扣动了扳机。
砰的一声，鲜血溅满草叶，占蓬倒了下去。
银幕前的观众目瞪口呆，做梦也没想到方新武竟然真的把占蓬打死了，这是国产警匪片史无前例的情节。不过他们没觉得方新武做错了，像占蓬这样的毒贩简直应该千刀万剐，被打死算便宜的，他们觉得方新武干得漂亮，心里有一种大仇得报的畅快感。
方新武像被人抽走了力气似的，神情颓丧的坐在地上。杀死占蓬让他对女友的死有了交代，也对无数个暗自隐忍、蛰伏在晦涩的黑色与灰色之中的日日夜夜有了交代，但警察的身份在告诉他这一切都是错的，他甚至觉得自己可能以后都没有资格再做警察了。
他就像做错了事的孩子，失声痛哭起来。
现场观众看到方新武痛哭的模样都非常心疼，他们感受到方新武能力的痛苦，也感受到了方新武内心的纠结，他们在心中不住安慰道，不用难过，你没有做错，象占蓬这样的毒贩罪该万死，你是在为民除害。
刘洋在心疼方新武的同时，对方致远的表演满意至极，这场戏方致远的表演有如神助，将方新武内心的痛苦和挣扎完美的刻画了出来。他觉得让方致远来演方新武太正确了，除了方致远，他实在想不出还有哪个年轻演员能演方新武，能把方新武演到这种程度。
他忍不住心想，明年的金鸡奖，评委们肯定要纠结了，《天才枪手》中的张捷和《湄公河行动》中的方新武都演得极为出色，到底该提名哪个角色，评委们肯定要头疼了！
有张捷和方新武两个角色在手，方致远金鸡奖提名稳了！
不知道《天才枪手》会不会报名参加金马奖，不然肯定能拿到金马奖影帝提名；不知道《湄公河行动》会不会报名参加金像奖，不然有机会拿到金像奖影帝提名！
镜头切到四国联合临时指挥所，四个国家的国旗迎风招展。
两个娃娃兵出现中银幕中，望着指挥部四国国旗怔怔出神。
现场观众的心都提了起来，之前大师就是因为娃娃兵的出现而身受重伤，最终不得不截肢，现在娃娃兵又出现了，恐怕又有大事发生。
观众的预感是正确的，一个娃娃兵背着炸药冲入进入大楼后，外面的娃娃兵通过手机引爆了炸药。伴着一声巨响，四国联合指挥部爆出一团猛烈的火焰，瞬间被夷为平地。
镜头切换，现场一片狼藉，滚滚浓烟中救援人员正在疏散人群。
现场观众全都变成了雕塑，怔怔望着银幕说不出话来。他们做梦都想不到糯康会嚣张到这种程度，这简直已经被不能用疯狂来形容，其作死程度堪比卡扎菲。把四国联合指挥所炸了，这是在打四个国家的脸，这四个国家不可能放过他。
镜头切到医院，高刚和方新武来到医院看望在爆炸中受了重伤的郁平局长。方希武告诉郁平，他们已经将逃跑的拿突抓回来了。郁闷听到这话笑了，让他们尽快行动。
从拿突口中知道糯康老巢所在后，特别行动小组全副武装，悄悄向糯康老巢靠近。与此同时，糯康背后的老板决定做掉糯康，让宋比塔带了一队人马干掉糯康，只有糯康死了，老板才能避免被牵连。
就在特别行动小组摸到糯康营地旁边，为进攻作准备的时候，宋比塔发现了高刚他们。黄雀在后的宋比塔立刻用对讲机通知狙击手开枪。伴随着一声清脆的枪响，木星身上暴起一团血花，重重倒了下去。
枪声传来，让所有人都是一惊。营地顿时炸开了锅，赌们端着枪冲出来。二郎引爆路上的滚雷，炸断了跑过来的毒贩的腿。野牛队冲进排屋，制住波哈。其余小队开始向毒贩开火。高刚用闪光弹闪掉娃娃兵，被队员们将他们拽离竹屋。
竹楼上的糯卡扛着重机枪冲出来，对着下面不分敌我向下扫射。糯康的手下也纷纷去拿重武器作战。就在这个时候，倒地的木星凭着一口气拿出遥控器，启动了武器库下面的炸药，武器库顿时化为一片火海。
高刚他们与毒贩猛烈交火，整个营地瞬间变成了战场。
林超闲是军事迷，拍枪战场面是他的拿手好戏，只不过从前在香江拍警匪片只能拍小打小闹的场面，这次《湄公河行动》给了他全方位展现自己这方面能力的机会。
他不但将这场动作戏拍的花样百出，有激烈的枪战、有凶猛的白刃战，还有拳拳到肉的格斗，而且演员们的动作极为写实，每一个动作都符合战术标准，就连现场的公安干警都不住点头，觉得这场戏精彩极了，完全达到了军事动作片级别。
记者们自然不用不说，看到特别行动小组大杀四方，都觉得热血沸腾，恨不得钻进银幕，化身为特别行动小组的成员，跟高刚他们一起围剿这些可恶的毒贩。
刘洋不是林超闲的影迷，但林超闲的每一部电影都看过。他觉得《湄公河行动》在惊险感、动作戏难度方面，比林超闲之前的作品提升了一个档次，绝对是最近几年场面最大、最火爆的华语动作片。